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Esta teoría fue propuesta por Charles Darwin; en la cual dice que un grupo es monofilético, si todos los organismos incluidos en él; han evolucionado a partir de una población ancestral común; y todos los descendientes de ese ancestro están incluidos en el grupo.
Por el contrario, un grupo que contiene algunos pero no todos los descendientes del ancestro común más reciente se llama parafilético, y un grupo taxonómico que contiene organismos pero carece de un ancestro común se llama polifilético.
Ejemplo: Se cree que todos los organismos en el género Homo proceden de la misma forma ancestral en la familia Hominidae. Así pues, el género Homo es monofilético.
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